如何繪制與疾病嚴重程度相關的病毒蛋白

一組艾滋病研究人員，細胞生物學家和生物物理學家共同支持COVID-19科學，他們確定了冠狀病毒蛋白的原子結構，認為該蛋白有助于病原體逃避和抑制人類免疫細胞的反應。結構圖-現在發表在PNAS雜志上，但自8月以來一直為科學界開放使用-為專門針對SARS-CoV-2量身定制的新型抗病毒治療奠??定了基礎，并使得能夠進一步研究新出現的病毒破壞了人體。

 

“使用X射線晶體學，我們建立了ORF8的原子模型，并突出顯示了兩個*的區域：一個僅存在于SARS-CoV-2及其直接的蝙蝠祖先中，另一個不存在任何其他冠狀病毒。”加州大學伯克利分校教授，勞倫斯伯克利國家實驗室(伯克利實驗室)的前任科學家詹姆斯·赫里(James Hurley)說。“這些區域穩定了這種蛋白質，這種蛋白質是一種分泌性蛋白質，不像病毒的特征性突突蛋白質那樣與膜結合，并創造了新的分子間界面。我們和研究界的其他人認為，這些界面參與了某種程度上引起反應的反應。 SARS-CoV-2的病原性比其進化株高。”

聚焦結構生物學

蛋白質結構圖的生成總是很費力的，因為科學家們必須設計細菌，這些細菌可以抽出大量分子，將分子操縱為純晶體形式，然后對晶體進行許多X射線衍射成像。這些圖像-由X射線束反射出晶體中的原子并穿過晶格中的縫隙，產生斑點圖案產生-通過特殊軟件進行組合和分析，以確定每個原子的位置。根據蛋白質的復雜程度，這一艱苦的過程可能需要數年時間。

對于許多蛋白質，通過將未溶解分子的結構與其他具有相似氨基酸序列的蛋白質(已作圖)進行比較，可以幫助構建圖譜。科學家可以對蛋白質如何折疊成3D形狀做出明智的猜測。

但是對于ORF8，團隊必須從頭開始。ORF8的氨基酸序列與其他蛋白質*不同，因此科學家對其整體形狀沒有參考，而蛋白質的3D形狀決定了其功能。

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來源：生物幫

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