新方法推動『DNA殘留檢測』進(jìn)入新篇章

在分子生物學(xué)領(lǐng)域中，準(zhǔn)確測量DNA或RNA分子的數(shù)量是實驗的關(guān)鍵步驟。

傳統(tǒng)的PCR技術(shù)在這方面發(fā)揮了重要作用，但它存在著一些局限性。為了解決傳統(tǒng)PCR技術(shù)的限制，并提高分子檢測的準(zhǔn)確性和靈敏度，數(shù)字PCR（dPCR）應(yīng)運而生。

本文將追溯dPCR的發(fā)展歷程，探討其在分子生物學(xué)研究中的重要性與相關(guān)應(yīng)用。

dPCR技術(shù)的起源

一般認(rèn)為，早期的數(shù)字PCR可以追溯到20世紀(jì)90年代，當(dāng)時研究人員使用微小的PCR反應(yīng)體積來檢測單個分子。這種方法被稱為限制性酶消化PCR（RE-PCR），它使用限制性酶將DNA分子切成小片段，然后對這些小片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

在二十世紀(jì)末，研究人員開始使用微流控技術(shù)來制造微小的反應(yīng)體積。這種方法被稱為微滴數(shù)字PCR（ddPCR），它可以將單個DNA分子分隔成數(shù)百萬個微小的反應(yīng)體積中。這種技術(shù)可以提高PCR反應(yīng)的靈敏度和精確性，并且可以用于檢測罕見的突變和低拷貝數(shù)的DNA序列。

dPCR的原理與優(yōu)勢

dPCR是一種基于單分子級別的PCR擴(kuò)增技術(shù)。與傳統(tǒng)的PCR相比，dPCR將反應(yīng)混合物分割成更小的單元，使每個單元中只有一個分子。通過限定性稀釋，可以確定反應(yīng)體系中的模板分子數(shù)。然后，利用熒光標(biāo)記或探針技術(shù)檢測每個單元中是否存在目標(biāo)序列，并計算目標(biāo)分子的絕對數(shù)量。

dPCR的優(yōu)勢dPCR在許多方面優(yōu)于傳統(tǒng)PCR。首先，作為一種絕對定量的方法，dPCR能夠提供更高的靈敏度和準(zhǔn)確性，尤其對于低豐度的目標(biāo)分子。其次，由于每個單元都是獨立擴(kuò)增和檢測的，因此dPCR對于抑制物的影響更小，結(jié)果更可靠。此外，dPCR還具有較寬的動態(tài)范圍和更好的檢測限度，能夠檢測罕見突變和微小的拷貝數(shù)變化。

?dPCR的應(yīng)用

dPCR已廣泛應(yīng)用于宿主細(xì)胞DNA殘留檢測、基因表達(dá)分析、突變檢測、病原體檢測和液體活檢等領(lǐng)域。在基因表達(dá)研究中，dPCR能夠準(zhǔn)確測量不同基因的表達(dá)水平，并發(fā)現(xiàn)低豐度的轉(zhuǎn)錄變異。在突變檢測中，dPCR能夠檢測罕見突變，對于腫瘤早期診斷和治療選擇具有重要意義。在病原體檢測方面，dPCR的高靈敏度和準(zhǔn)確性使其成為檢測感染病原體的理想工具。在液體活檢中，dPCR可以通過檢測循環(huán)腫瘤DNA來監(jiān)測腫瘤動態(tài)變化，為腫瘤的診斷和治療提供重要依據(jù)。

未來，dPCR可能會被更廣泛地應(yīng)用于許多領(lǐng)域，包括醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、環(huán)境科學(xué)和食品安全等。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，dPCR可以用于檢測癌癥和其他疾病的DNA標(biāo)記物，以及監(jiān)測藥物治療的效果；在環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域，dPCR可以用于檢測水和土壤中的微生物和污染物。在食品安全領(lǐng)域，dPCR可以用于檢測食品中的病原體和污染物。